然而，咖啡馆的新信息和自由的探讨，也让学生热衷于泡咖啡馆，这让部分研究者忧心忡忡。他们担心学生把时间浪费在咖啡馆，这将断送年轻人的未来。也有人指出，咖啡馆能让年轻人了解世界和学会高雅的品位。 由于咖啡廉价，咖啡馆被称为“便士大学”（penny university），还有歌谣流传：“这么好的大学，从未有过；花上一便士，就能当学者。” 对科学研究团体而言，咖啡馆是他们讨论问题、科学创新的重要场所。英国皇家学会会长罗伯特·胡克在咖啡馆展示了对天文象限仪的改进；胡克、哈雷和雷恩在咖啡馆关于“万有引力”的一次闲聊，由哈雷转述给牛顿之后，催生出科学革命最伟大的著作《自然哲学的数学原理》。
不同的咖啡馆根据所在地的主要活动专门讨论不同的题目，比如，商人、医生、科学家等不同的群体，他们会定时在某个专门的咖啡馆出现，以便生意伙伴或朋友能找到他们。由于咖啡馆在当时营造出了平等社交空间、倡导言论自由，咖啡馆也成了发表新作的地方。